ख़ुमैनी ने खुद को ईरान शासित इस्लामिक राज्य में बदलने के अपने दृढ़ संकल्प में अटूट साबित किया। ईरान के शिया धर्मगुरुओं ने बड़े पैमाने पर सरकारी नीति बनाई, जबकि खुमैनी ने विभिन्न क्रांतिकारी गुटों के बीच मध्यस्थता की और महत्वपूर्ण मामलों पर अंतिम निर्णय लिया, जिसमें उनके व्यक्तिगत अधिकार की आवश्यकता थी। पहले उनके शासन ने राजनीतिक प्रतिशोध लिया, सैकड़ों लोगों के साथ, जिन्होंने शाह के शासन के लिए कथित तौर पर काम किया था। शेष घरेलू विरोध तब दबा दिया गया था, इसके सदस्यों को व्यवस्थित रूप से कैद या मार दिया गया था। ईरानी महिलाओं को घूंघट पहनने की आवश्यकता थी, पश्चिमी संगीत और शराब पर प्रतिबंध लगा दिया गया था, और इस्लामी कानून द्वारा निर्धारित दंडों को बहाल किया गया था। खुमैनी की विदेश नीति का मुख्य जोर शाह के पश्चिमी अभिविन्यास का पूर्ण परित्याग और दोनों महाशक्तियों, संयुक्त राज्य अमेरिका और सोवियत संघ के प्रति असंबद्ध शत्रुता का रवैया अपनाने का था। इसके अलावा, ईरान ने अपने मुस्लिम आबादी वाले देशों में, विशेष रूप से शिया आबादी के बीच अपने इस्लामी पुनरुत्थानवाद के ब्रांड को निर्यात करने की कोशिश की। खुमैनी ने ईरानी आतंकवादियों के तेहरान (4 नवंबर, 1979) में अमेरिकी दूतावास को जब्त करने और एक वर्ष से अधिक समय तक अमेरिकी राजनयिक कर्मियों को बंधक के रूप में रखनेको मंजूरी दे दी। (ईरान बंधक संकट देखें) उन्होंने ईरान-इराक युद्ध के शांतिपूर्ण समाधान के लिए मना कर दिया, जो 1980 में शुरू हुआ था और जिसे उन्होंने सद्दाम को उखाड़ फेंकने की उम्मीद में लंबे समय तक जोर दिया था। खोमैनी ने आखिरकार 1988 में युद्ध विराम को मंजूरी दे दी, जिसने युद्ध को प्रभावी रूप से समाप्त कर दिया (स्रोत: ब्रिटानिका)।