13 वीं शताब्दी के बाद, क्षेत्र में पारसी का कोई उल्लेख नहीं है। माना जाता है कि मंगोल आक्रमणकारियों ने उन्हें नष्ट कर दिया था। यहां तक कि टाग्रिट के ईसाई, जिन्हें मेसोपोटामिया के मंगोल आक्रमण के दौरान शुरू में बख्शा गया था, उन्हें 1258 में मौत की सजा सुनाई गई थी, जब मंगोलों को पता चला कि उन्होंने मुस्लिम पीड़ितों की संपत्ति नहीं सौंपी है। क्रॉनिकॉन एड एसी 1234 पर्टिनेंस के गुमनाम लेखक ने कहा कि आक्रमणकारियों को किसी पर दया नहीं आई, लेकिन उन्होंने स्वीकार किया कि वे मुसलमानों के प्रति विशेष रूप से अविश्वसनीय थे। यह तथ्य कि मंगोल मुस्लिम वर्चस्व को समाप्त कर रहे थे और धार्मिक स्वतंत्रता प्रदान कर रहे थे, गैर-मुसलमानों के डर को कम कर दिया। मंगोलों के बीच कई कट्टरपंथियों को देखकर ईसाइयों को और आश्वस्त किया गया।
नतीजतन, ईसाइयों ने मंगोल सम्राटों की सहानुभूति हासिल करने का मौका जब्त कर लिया। जब तक चंगेज खान का बेटा उगाडे (1229-1241) सिंहासन पर बैठा, तब तक कई ईसाइयों को मेसोपोटामिया और फारस से मंगोल दरबार में भेज दिया गया था। पूर्वी सिरिएक इतिहास युगेडे पर नेस्टोरियन चिकित्सक शिमोन के प्रभाव को प्रमाणित करता है। मंगोलशाद के बीच शिमोन की प्रतिष्ठा ने गैंट्ज़क के अर्मेनियाई इतिहासकार किराकोस को भी प्रभावित किया। शिमोन के लिए अर्मेनियाई इतिहासकार की सहानुभूति आश्चर्यजनक नहीं है क्योंकि बाद वाले ने मंगोलों को काकेशस की ईसाई आबादी को परेशान नहीं करने के लिए राजी किया था। राशिद अल-दीन के अनुसार, उगाडे एक दयालु शासक था जिसने विभिन्न पंथों के लोगों के बीच भेद नहीं किया। वह उन उदाहरणों की एक श्रृंखला का हवाला देता है जिसके दौरान उगाडे ने मुसलमानों के जीवन को बख्शा था जिन्होंने नदियों के उपयोग और जानवरों के वध के संबंध में मंगोल कानूनों का उल्लंघन किया था। राशिद अल-दीन ने यह भी रिकॉर्ड किया कि उगाडे ने बिना किसी भेदभाव के मंगोलों और मुसलमानों दोनों को धन वितरित किया। जबकि रशीद अल-दीन ने अपने जामी अल-तवारीख में मुसलमानों के प्रति मंगोलों की उदारता का प्रदर्शन करने का लक्ष्य रखा, वहीं उन्होंने मंगोलों के लिए गैर-मुस्लिमों की पसंद को स्पष्ट करने वाली जानकारी भी प्रस्तुत की।
मंगोल कानून या यासा विशेष रूप से ईसाइयों के अनुकूल कानून नहीं था, लेकिन इसने उन पर इस्लामी कानून (शरिया) के प्रतिबंध नहीं लगाए। इसने एक ऐसी स्थिति उत्पन्न की जिसमें ईसाइयों को सत्ता में न होते हुए भी इसे प्राप्त करने की आशा थी। मंगोलों की सहानुभूति बनाए रखने के लिए उन्हें अपनी राजनीतिक सरलता का आह्वान करना पड़ा। उगाडे के बेटे गयुक (1246-1248) को ईसाइयों से घिरा हुआ लाया गया था। उनकी मां एक ईसाई थीं, और उनके शिक्षक कदक, अताबेग भी थे। उनके पास चिंकाय नाम का एक और ईसाई जादूगर भी था। दूर यूरोप में पर्यवेक्षकों के लिए, ईसाई धर्म के अलावा किसी अन्य धर्म के लिए ग्युक का पालन अजीब लग रहा था, और उन्होंने यह राय बनाई कि उनके गैर-रूपांतरण का दोष उनके ईसाई अधिकारियों के पास था, जिन्होंने उस पर उसे सही करने के लिए पर्याप्त दबाव नहीं डाला था। आस्था। यह वह धारणा थी जिसने पोप को गयुक को एक पत्र भेजने के लिए प्रेरित किया जिसमें उन्हें बपतिस्मा स्वीकार करने का निर्देश दिया गया था। गयुक ने इनकार कर दिया, यह विश्वास करते हुए कि दुनिया को उसे प्रस्तुत करना था, न कि वह रोम के धार्मिक अधिकार के लिए। ईसाई धर्म अपनाने से इनकार करने के बावजूद, गयुक ने स्पष्ट रूप से ईसाइयों के प्रति अपने पक्ष का प्रदर्शन किया। जुज्जानी का कहना है कि इन लोगों ने गयुक से मुसलमानों को नीचा दिखाने का आग्रह किया, लेकिन एक चमत्कार ने खान को इस योजना को लागू करने से रोक दिया। एक अन्य उदाहरण में, एक मुस्लिम इमाम को अदालत में लाया गया जहां उसके नबी को एक सामान्य व्यक्ति के रूप में एक महान यौन भूख के साथ बदनाम किया गया था। रशीद अल-दीन का आरोप है कि गयुक ने अपने साम्राज्य के मामलों को दो ईसाई वज़ीरों (क़दक़ और चिंकाय) को सौंप दिया था और परिणामस्वरूप ईसाइयों का कारण फला-फूला। इराक में सेना की कमान जैसे प्रमुख पद ईसाइयों को दिए गए थे, और जैसा कि कोई उम्मीद कर सकता है कि ईसाइयों को भी पश्चिमी अदालतों में मंगोल राजदूत के रूप में चुना गया था। फ्रांस के राजा लुई IX (1226-1270) ने दो ऐसे ईसाई राजदूत प्राप्त किए जिन्होंने उन्हें ईसाइयों के प्रति मंगोलों के उदारवाद का वर्णन किया और उन्हें बताया कि सभी ईसाइयों को कराधान से छूट दी गई थी।
