इसके बाद अगले सितंबर में एक और सामान्य सत्र होगा। पहला सत्र शुरू होने के तुरंत बाद, हालांकि, वसंत ऋतु में कोई बैठक नहीं करने का निर्णय लिया गया। सितंबर में केवल एक बैठक होगी, जो 1946 के सत्र का दूसरा भाग होगी। विधानसभा की पहली बैठक 10 जनवरी 1946 को वेस्टमिंस्टर के सेंट्रल हॉल में हुई थी। लगभग इसका पहला कार्य सत्र के लिए एक अध्यक्ष का चुनाव करना था। यह एक विवादास्पद मामला साबित हुआ। जैसे ही कार्यवाही शुरू हुई, सोवियत प्रमुख प्रतिनिधि, ग्रोमीको, मंच पर पहुंचे और तुरंत घोषणा की कि वह राष्ट्रपति के रूप में नार्वे के विदेश मंत्री, ट्रिगवे लाई के चुनाव का समर्थन करते हैं। लाई एक बार राष्ट्रपति पद के लिए अमेरिकी उम्मीदवार थे, पिछले अगस्त में स्टेटिनियस द्वारा संपर्क किया गया था, और दिसंबर में प्रिपरेटरी कमीशन के अमेरिकी प्रतिनिधि स्टीवेन्सन द्वारा फिर से संपर्क किया गया था। विधानसभा सत्र शुरू होने से एक या दो दिन पहले, हालांकि, संयुक्त राज्य अमेरिका ने उसके लिए अपना समर्थन वापस ले लिया, और इसे बेल्जियम के विदेश मंत्री, एक कट्टर पश्चिमी समर्थक और कम्युनिस्ट विरोधी राजनेता, स्पाक को स्थानांतरित कर दिया, जिसे ब्रिटेन द्वारा भी समर्थन दिया गया था और अन्य देश।
हालाँकि, स्पाक सोवियत संघ के लिए किसी भी तरह से स्वीकार्य नहीं था, क्योंकि उनके मजबूत राजनीतिक विचारों के कारण। नामांकन से घबराए हुए रूसी अंततः अंतिम समय में अमेरिकी प्रतिनिधिमंडल को लाई के समर्थन में वापस लौटने के लिए राजी करने में सक्षम थे। इस प्रकार, ग्रोमीको का समर्थन करने वाले यूक्रेनी प्रतिनिधि ने प्रस्ताव दिया कि लेट को बिना मतपत्र के अभिनंदन द्वारा चुना जाना चाहिए। इसे विधानसभा ने खारिज कर दिया था। अमेरिकी प्रतिनिधिमंडल ने, अब दो दिमागों में, लाई के लिए अपने समर्थन की कोई घोषणा नहीं की। इस प्रकार इस घटना में, मजबूत सोवियत विरोध के बावजूद, स्पाक को २८ मतों से २३ मतों से राष्ट्रपति चुना गया था। इसे आम तौर पर रूसियों के लिए एक महत्वपूर्ण राजनीतिक हार के रूप में माना जाता था, जो स्पाक को नापसंद करने के लिए जाने जाते थे। पूरे मामले ने विधानसभा की पहले दिन की कार्यवाही में एक अशुभ स्वर दिया।
संगठन के महासचिव का चुनाव कहीं अधिक महत्वपूर्ण था जिसका पालन किया जाना था। इस पर कुछ समय से अनौपचारिक चर्चा हुई थी। इस मामले में वीटो संचालित होता था, इसलिए पहली अनिवार्यता यह थी कि उम्मीदवार सभी स्थायी सदस्यों को स्वीकार्य होना चाहिए। एंथोनी ईडन से लेकर जनरल आइजनहावर तक कई नामों पर अस्थायी रूप से चर्चा की गई थी। हालांकि, आम तौर पर इस बात पर सहमति बनी कि यह पद किसी एक प्रमुख शक्ति के नागरिक के पास नहीं जाना चाहिए। अमेरिकी सरकार ने एक अमेरिकी महासचिव के सुझावों को सक्रिय रूप से हतोत्साहित किया, विशेष रूप से संयुक्त राज्य अमेरिका को संगठन के मुख्यालय की साइट के रूप में चुने जाने के बाद।
इसके बजाय संयुक्त राज्य अमेरिका की पहली पसंद कनाडा के लेस्टर पियर्सन बने। हालाँकि, उन्हें रूसियों द्वारा बहुत अधिक पश्चिमी समर्थक माना जाता था। उन्होंने एक यूगोस्लाव, सिमिक का प्रस्ताव दिया, जो पहले यूगोस्लाव सरकार के निर्वासित सदस्य थे, लेकिन अब टीटो की सरकार में विदेश मंत्री हैं। वह, जैसा कि रूसियों को पता होगा, संयुक्त राज्य अमेरिका और अन्य पश्चिमी देशों के लिए समान रूप से अस्वीकार्य था। नीदरलैंड के वैन क्लेफेंस और पोलैंड के रज़ीमोस्की सहित कई अन्य नामों का उल्लेख किया गया था।